Aus den Schriften der Historiker geht hervor, dass die Kirche von Deir Al-Garnous im Laufe der Jahrhunderte drei Namen hatte:
‚Abai Issous‘ (Heim von Jesus): Dies war der erste Name der Kirche nach dem Besuch des Jesuskindes. Dies berichtet uns Anba Kyriakos Kyriakos, Bischof von Al-Bahnasa in seinem Manuskript, das er im siebten Jahrhundert n. Chr. schrieb.
Der zweite Name ‚Arganos-Kirche‘ stammt aus dem Französischen und bedeutet ‚Erkundigung und Überprüfung‘. Dieser Name, der in den Schriften der Historiker vorkommt, leitet sich ab von der Funktion des darin befindlichen Brunnens, in dem man damals die Wasserhöhe des Nils gemessen hat.
Die dritte Bezeichnung ist ‚Jungfrau Maria Kirche in Deir Al-Garnous‘. Dieser ist der Name der heutigen Kirche, die auf den Ruinen der alten Kirche errichtet wurde und war auch der Name der früheren Kirche, etwa 300 Jahren davor in der arabischen Ära.
Der Historiker Mohamed Ramzy erwähnte den Ort in seinem ‚Geographischen Wörterbuch des altägyptischen Landes‘ als ‚Nahiyat Al-Garnous‘.
