Zisternen sind geschlossene, dichte Behälter oder Räume zum Speichern von Wasser mit Öffnungen zum Ausschöpfen des Wassers. Römische Zisternen hatten drei Öffnungen: eine für die Wassereinfuhr, eine für die Wasserentnahme und eine für die Reinigung. Die alte Zisterne unter der Haret Zuweila Kirche ist eine große römische Hauptzisterne, keine kleine Hauszisterne. Die Heilige Familie verwendete das Wasser dieser Zisterne, als sie sich an diesem Ort ausruhte.
Die Zisterne hat eine Fläche von etwa 80 m2. Ihr Bodenniveau liegt 8m niedriger als das Straßenniveau. Den Zisternenraum schaffen tragende Wände mit versiegeltem Putz und flache Gewölbe und Kuppeln aus Ziegeln.
Der Zugang zur Zisterne erfolgt auf der nordwestlichen Seite der Kirche durch einen Hohlraum vom Innenhof aus, der zur Zisterne führt. Den Zugang hat Institut für Koptologie – Fachbereich Architektur nach nach sorgfältiger Vermessung freigelegt. Bei der Freilegung war die Zisterne mit Wasser gefüllt. Dank eines staatlichen Projekts zur Abwasserregelung in der Al-Kharunfeesh-Straße und Senkung des Grundwasserspiegels in der Gegend konnte der Grundwasserspiegel gesenkt werden, sodass die Zisterne zur Besichtigung zugänglich geworden ist.