La aparición de la Virgen María en este bendito monasterio se presenta como una gran imagen luminosa y refulgente que aún suele presentarse de vez en cuando. Este monasterio es un lugar en donde los fieles encuentran adversidad, consuelo, paz y alegría.
La Virgen María destacó la importancia de este monasterio brindando su bendición apareciéndose allí y transfigurándose en su radiante gloria divina. Se ha relatado un hecho ocurrido cuando una mujer musulmana velada que caminaba cerca de la iglesia vio a la Virgen de pie en el techo de la iglesia entre los dos minaretes e imaginó que era una mujer que intentaba suicidarse o que intentaba quitar la cruz que estaba fijada en la farola, por lo que de inmediato se apresuró a informar a los oficiales del lugar.
El 17 de agosto de 2000 durante el ayuno que se realiza en conmemoración de la Virgen, se dio inicio a la aparición de la Virgen cuando de forma súbita unas luces deslumbrantes brillaron en la Iglesia de San Marcos en la ciudad de Assiut (la antigua archidiócesis), que se encuentra a pocos kilómetros de la cueva del Monte Assiut en el Monasterio de Drunka. Estas luces brillaban sobre los faroles y las cruces situadas sobre los feligreses, que a veces, tal luminosidad cubría toda la iglesia y también las calles que rodean la iglesia se iluminaron con luces deslumbrantes cuyo origen se desconoce. Durante muchas noches permanecieron brillando a intervalos cortos hasta el comienzo del amanecer. También, tuvo lugar la aparición de una gran paloma luminosa dentro de una nube resplandeciente, el evento de tal manifestación se extendió durante varios minutos sobre el área de la iglesia.
Además, aconteció la aparición de bandadas de grandes palomas luminosas, a lo que los miles de presentes en el lugar respondieron con vítores, himnos y oraciones. Estos feligreses acuden a la iglesia desde todo Egipto y el mundo entero.
El periódico Watani en su publicación emitida el domingo 22 de octubre de 2000 que corresponde al 12 Bab 1717, Calle Al-Sunnah, número 42, emisión 2026, señaló “La celebración fue acompañada por la aparición de la Virgen María con numerosos fenómenos extraños, tales como luces blancas como la nieve sobre las cúpulas y entre los faroles con incienso espeso de un agradable aroma y, además, se manifestó la liberación de formas espirituales, tales como grandes palomas volando sobre el lugar.
Su Santidad el papa Shenouda III en su homilía del día miércoles 22 de noviembre de 2000 afirma que “La milagrosa aparición en la Iglesia de San Marcos Apóstol en la ciudad de Assiut respalda la opinión de que la Sagrada Familia, en su camino de regreso, pasó por la cueva ubicada en el Monte Assiut en el Monasterio de Drunka cerca de este lugar y al que le otorgaran su bendición.