L’église de Sakha renferme d’importantes reliques dont la plus précieuse est la pierre portant l’empreinte du pied de Jésus (Pikhaysous). Elle représente une bénédiction pour tous ceux qui visitent l’église et une source de nombreux miracles, qui se sont accomplis à différentes époques.
Parmi ces reliques, il y a aussi la couronne d’un pilier, enterrée près de la pierre et retrouvée lors de travaux de fondation d’une maison qui se trouve derrière la nouvelle église, construite à l’époque de sa Sainteté le feu Pape Chenouda III.
On y trouve également un bassin de granite où la Vierge Marie avait pétri du pain ainsi qu’un petit moulin en pierre pour moudre le grain.
Dans les bâtiments de l’église se trouvent des objets antiques précieux dont des icônes peintes par l’artiste Anastase Al-Qudsi (de Jérusalem) vers environ 1884, un chandelier offert par Ismaïl Pacha, gouverneur d’Egypte en 1862, la chaise de Son Eminence Monseigneur Zacharie, évêque de Sakha en 725, ainsi qu’une collection rare de manuscrits et de bibles.
Il s’y trouve aussi un calice dédié à la sainte Communion, un plateau et un chandelier en argent massif et un certain nombre d’antiquités rares datant du XIXe siècle.
Enfin, la ville de Sakha est connue pour son célèbre pilier sur lequel Saint Agathon Al-‘Amoudi se tenait debout pendant 50 ans, au VIIe siècle après J.C.