Situé à droite de la porte-nord, on y accède depuis le toit de l’entrée-nord de l’ancienne église de la Vierge à Qantara. Daté du VIIe siècle après JC et appelé autrefois « l’ancien palais », le fort se compose de trois étages. Le rez-de-chaussée, qui était destiné aux réserves de nourriture et disposait d’un puits d’eau, le deuxième étage où se trouvait l’entrée principale du fort et comprenait les cellules des moines et, enfin, le troisième étage où se trouve l’église principale de l’Archange Michael. Juste à côté, se trouve une salle avec une cache spéciale pour les objets sacrés du monastère.
Selon l’égyptologue Evelyn White, le fort est actuellement considéré, sur le plan architectural, comme la plus ancienne fortification existante à Wadi El-Natrun.
Le fort a été rénové aux frais du Mo’allem Ibrahim al-Gohari en 1773. Il a connu une deuxième restauration en 1996.