L’église remonte au IVe siècle et possède trois sanctuaires, dont le principal est dédié à Saint Bishoy, est connecté au *Khurus par un haut portail orné de panneaux en bois datant de l’époque Fatimide.
Le sanctuaire nord est dédié à la Sainte Vierge et celui plus au sud à Saint-Jean Baptiste, dont un mur est couvert de peintures antiques.
Des reliquaires contenant la dépouille de Saint-Bishoy et les reliques de Saint-Paul de Tammah sont placés au nord-est du Khurus, alors que les restes du Pape Benjamin II se trouvent eux, au sud-ouest de la nef.
Dans la nef, un pupitre en bois précieux datant du VIe siècle, utilisé par les pères spirituels pour prêcher à leurs disciples ou par les prêtres qui apprennent la foi chrétienne à leurs paroissiens.
Le pupitre a une surface en mètres carrés de 2×2 m2, sa balustrade s’élève à 1.5 mètres du sol. Elle est fixée par une colonne en bois et repose sur un mur qui sépare le premier du second Khurus.
L’église possède également une icône de la Sainte Vierge qui remonte au 4ième siècle et une autre de Mar Girgis (Saint-Georges) qui date, elle, du 5ième siècle après JC.
On trouve également dans le premier tiers de l’église, un portail en bois de 7 mètres de haut qui date du 11ième siècle.
* Un Khurus, du grec Choros, est une caractéristique architecturale des églises coptes orthodoxes qui consiste en un espace sur toute la largeur de l’établissement qui sépare la nef du sanctuaire ou presbytère et qui est réservé au clergé, comme le chœur dans l’architecture des églises occidentales.
