Anticamente, i soldati romani edificarono una chiesa sopra la grotta di Abu Serga e la chiamarono al nome di due Santi da loro molto venerati, ovvero i Santi Sergio e Bacco, martirizzati all’epoca di Massimiano ( 280- 305 d.C.) ; la chiesa fu conosciuta piu` tardi come chiesa di Abu Serga.
Essa rimase la Cattedra o la Sede Episcopale dal quarto al tredicesimo secolo. Inizialmente era nota come la Cattedra di Babilonia, poi di El Fustat poi divento` la Cattedra dell’Egitto.
Secondo altre fonti, la chiesa fu fondata verso la fine del settimo secolo per opera di Atanasio che venne dalla Siria, dopo aver conosciuto la storia dei due Santi Sergio e Bacco, e costruὶ questa chiesa. Essa segue l’ordine architettonico rinascimentale, e` lunga 27 metri, larga 17 metri ed alta 15 metri. Il livello della pavimentazione e` inferiore a quello della strada di quasi 3.90 metri. L’ingresso induce alla navata ed ai tre altari sotto i quali si trova la grotta antica. Le colonne della navata hanno dei capitelli di stile Corinzio che sono risalenti al quarto e al quinto secoli d.C. Nell’altare meridionale e` stato scoperto ultimamente un affresco risalente al tredicesimo secolo, oltre a tante icone monumentali.
La chiesa e` collocata quasi al centro del “Palazzo della Cera” oppure la Fortezza romana di Babilonia, vicino al Museo Copto.
Verso la fine del Califfato Omayyade, la chiesa fu incendiata, quando Marwan П, ultimo Califfo della Famiglia degli Omayyadi (744-750 d.C.) diede fuoco al Fustat. Nel 1102 d.C., Youhanna Ibn Youssef, noto anche come Ibn El Abah, Ministro e Segretario del Califfo Fatimide Al Muntasir, fece restaurare la chiesa.
Nel 768 d.C., il Califfo Marwan Ibn Mohamed rilascio` il Patriarca Anba Michele І ( il 46esimo Patriarca), il quale ando` poi alla chiesa di Abu Serga e recito` una preghiera di ringraziamento al Signore.
Nell’859 d.C., fu eletto il Patriarca Anba Shenouda (il 55esimo Papa) e fu il primo Patriarca consacrato in questa chiesa.
Nel 975 d.C. ci venne eletto il Patriarca Anba Abramo il Siriaco
(il 62esimo Papa). Nella sua epoca, fu spostata la montagna Il Mokattam.
In quei tempi, la chiesa di Abu Serga godeva di una posizione privilegiata e ne fu prova evidente l’elezione della maggior parte dei Patriarchi che si svolgeva in questa chiesa fino agli inizi del dodicesimo secolo. In effetti, nel 1102 d.C. ci fu eletto il Patriarca Anba Macarius.
Attualmente, la chiesa custodisce i Corpi dei due Santi Sergio e Bacco nonche’ del Martire Monaco Bashnouna, le cui spoglie furono scoperte nel 1991 sotto il pulpito, durante la ristrutturazione della chiesa . In aggiunta, ci sono numerose icone antiche che decorano le pareti della chiesa.
Il Museo Copto conserva alcuni monumenti importanti provenienti dalla chiesa di Abu Serga, tra cui un altare in legno di noce, ritenuto il piu` antico nella storia delle antiche chiese, oltre a capitelli di stile Corinzio databili, molto probabilmente, al sesto secolo d.C.
