Dos escritos dos historiadores, a igreja de Deir Al-Garnous recebeu,
ao longo dos tempos, três nomes:
Igreja “Bay Issos”, foi o primeiro nome pelo qual ficou conhecida, após a visita de Cristo, louvado seja Ele, para a sua localização. Isto foi referido por Anba Quriakos, Bispo de Bahnasa, nas suas memórias compiladas no século VII d.C., sobre a Sagrada Família, que ali permaneceu durante quatro dias.
O segundo nome é “Igreja dos Arginos” referida por historiadores antigos nos seus escritos com este nome, tratando-se de uma palavra francesa que significa “inteligência e investigação”, em referência ao poço nele localizado que era utilizado para verificar a altura da água do rio Nilo.
Quanto ao terceiro nome, é a Igreja da “Virgem Maria, Mosteiro de Garnous”, que é o nome da atual igreja construída sobre as ruínas da antiga igreja e dedicada a esse nome, remontando à era árabe há cerca de 300 anos.
O historiador Muhammad Ramzi citou-a no Dicionário Geográfico dos Países do Antigo Egipto como “Nahiyat al-Garnus”.
