A localização da Igreja da Virgem Maria no deserto contribuiu para atrair algumas pessoas para viver e venerá-la devido à sua simplicidade, humildade e o privilégio único, pois este foi um refúgio seguro e confortável onde a Sagrada Família viveu, de uma maneira pobre e humilde, tornando este lugar um lugar abençoado.
Todos os que vieram para adorar e viver em solidariedade em redor da igreja, viveram na pobreza e humildade tal como viveu a Sagrada Família, e foi-lhes dito que lhes seria concedida a bênção de que o Senhor de Glória tinha abençoado este lugar e recebido a coroa da vida eterna no reino dos céus.
Dizia-se que alguns desses primeiros eremitas tinham uma boa relação com o grande Santo Anba António. Após a partida de Anba Pachomius, o pai dos grupos monásticos, os mosteiros pacomianos propagaram-se pelos seus discípulos (tais como Tadros e Orsios…) por todo o Egipto. Muitos outros grupos monásticos também seguiram as leis de Anba Pachomius sem se juntarem aos mosteiros da companhia pacomiana.
O estudo indicou que alguns dos alunos de Anba Pachomius, ou pelo menos um grupo de monges da comunhão pacomiana, vieram a Qusqam na segunda metade do século IV e participaram com os que viviam em redor da igreja na criação do mosteiro. O pai da igreja
(346 d.C.).
[Uma vez que os estudiosos da vida da comunidade pacomiana concordaram unanimemente que Anba Pachomius, fundou apenas nove mosteiros para monges e dois mosteiros para freiras, situados entre Akhmim no norte e Esna no sul], e a vida da comunidade era semelhante ao grupo da igreja inicial, onde tudo era comum entre eles (Actos 2:44). A base da sua vida física centrava-se na pobreza, na miséria, na falta de posses, na fuga do amor às posses. Quanto ao centro da vida espiritual do monge, era a Bíblia, a Eucaristia e a oração permanente.
Parece que o método aplicado das leis pacomianas no mosteiro de Qusqam tinha um cariz especial pelo que o mosteiro era famoso, pela sua abertura aos visitantes e àqueles que procuravam asilo, pedindo a cura da água do poço que Jesus abençoou e pedindo a súplica e intercessão da Mãe de Deus, a Virgem Santa Maria.
Foi noticiado que o rei Zenão, no final do século V, por volta de 481 d.C., residia em Qusqam, a pedido da sua filha Illaria, que tinha sido monge em Wadi El-Natrun, em nome do monge Illary. O rei Zenão ordenou a construção de fortalezas em todos os mosteiros egípcios, incluindo o Mosteiro de Muharraq.