A igreja é do século IV e engloba três santuários.
O santuário principal é dedicado a São Bíshoy e está ligado ao coro através de um pórtico superior com painéis de madeira ornamentada que datam do Período Fatímida.
O santuário a norte é dedicado à Santíssima Virgem Maria.
O santuário ao sul é dedicado a São João Baptista, possui algumas pinturas antigas na fachada oriental.
O relicário do corpo de São Bishoy e as relíquias de São Paulo de Tammah estão situadas no canto nordeste do coro, enquanto as do corpo do Papa Benjamim II estão situadas no canto sudoeste da nave.
A nave tem um púlpito valioso feito em madeira datado do século VI, foi utilizado por um sacerdote para pregar aos seus discípulos ou por um sacerdote para ensinar ao povo a fé cristã. O púlpito é feito de madeira, e tem uma área quadrada 2×2 m2, a balaustrada do púlpito fica a 1,5m do chão da igreja e é fixada por uma coluna de madeira que repousa sobre uma parede que separa o primeiro e o segundo coro.