A porta do santuário mais famosa em todos os mosteiros do Egipto é a porta do santuário do centro, ou a porta dos símbolos. É uma iconostasia que expressa a relação entre a Igreja de Alexandria e a Igreja de Antióquia. A inscrição escrita na língua síria no quadro superior do lado direito traduz-se como “Honrar, glorificar, louvar e venerar a Santíssima Trindade que é adorada e é igual na sua essência”. Depois uma cruz aparece no meio da moldura, no lado esquerdo, há outra inscrição que se traduz como “Preocupado em construir e erigir este altar Moisés,
o abade do mosteiro durante a era do Papa Gabriel I, o 57º Patriarca no ano 914 d.C., em honra da Virgem Maria”.
No quadro da esquerda, há inscrições que significam: “Deus, que pelo Seu santo nome os recompensará pelas suas boas ações, assim como a todos os crentes que participaram neste altar e neste santo mosteiro, salvação e vida, preservação para os seus filhos, misericórdia para com os seus mortos, perdão pelos seus pecados”. A porta é constituída por 6 portadas, divididas em 7 secções, que são feitas de madeira de pinho e gravadas com desenhos requintados e incrustadas com marfim.
Na primeira fila superior, encontramos ícones de madeira para um grupo de santos, que são da direita para a esquerda: Santo Severo – Santo Inácio – Santa Maria, a Theotokos – o ícone do Senhor Cristo – São Marcos o Apóstolo – e, finalmente, São Dióscoro. Aqui, constatamos que o Senhor Jesus Cristo segura um livro na sua mão esquerda e levanta a sua mão direita para conceder a bênção. Ele foi desenhado sob a forma de um jovem de barba limpa com uma auréola luminosa à volta da sua cabeça, sem cruz. Também encontramos a Virgem Maria de pé com o pé direito para a frente e a mão direita sobre o peito enquanto segurava com a mão esquerda uma das dobras do seu vestido.
Encontramos também os ícones do primeiro patriarca de cada igreja e dos patriarcas que mais foram perseguidos por causa da heresia de Nestório. Portanto, o segundo e quinto ícones representam São Marcos Apóstolo, os primeiros Patriarcas de Alexandria e Santo Inácio, os primeiros Patriarcas de Antióquia. Descobrimos que o pé esquerdo do Apóstolo São Marcos está ligeiramente avançado e parece que a sua mão direita está elevada até ao peito, mas a sua mão esquerda carrega um livro que ele segura no peito. Quanto ao primeiro e sexto ícones, eles representam Anba Severo, Patriarca de Antióquia de 512AD a 518AD, e o Papa Dióscoro, Patriarca de Alexandria de 444AD a 454AD.
Depois, nas filas seguintes, encontramos formas decorativas com imagens de diferentes cruzes. Alguns acreditavam que estas formas decorativas podiam expressar as diferentes etapas pelas quais a igreja passou até então. Diz-se que a primeira fila simboliza a era da propagação do cristianismo durante a era do estado romano e a era do martírio, enquanto que a segunda fila simboliza a era das Sés Apostólicas, que são: Alexandria – Jerusalém – Roma – Antióquia – Constantinopla – Cartago. Quanto à terceira fila, apresenta-se uma cruz com uma lua crescente à sua volta, simbolizando a emergência do Islão e a entrada dos árabes no Egipto. Já na quarta fila, aparece uma cruz curva, simbolizando a era da propagação das heresias. Quanto à quinta fila, simboliza a apatia espiritual e o grande número de seitas. Na última fila, a cruz aparece no meio, como sinal da unidade da Igreja, da união das igrejas, e da segunda vinda de Cristo (a esperada e aguardada).
