Ашмунайн оставался местопребыванием епископского престола на протяжении 1300 лет, с середины третьего века нашей эры и до середины шестнадцатого века нашей эры. Таким образом, местонахождение города Ашмунайн считается одним из старейших епископских престолов в Верхнем Египте.
В районе, известном как «Ком Эль-Кенисса», до настоящего времени сохранились развалины большой церкви в стиле базилики. Эта церковь существовала в течение шести веков, с момента своего создания в пятом веке нашей эры, пока не была разрушена в начале одиннадцатого века нашей эры.
Некоторые археологические экспедиции сообщали, что в церкви было 48 розовых гранитных колонн высотой около шести метров, а основания и капители колонн были выполнены из известняка.
Абу Аль-Макарем упоминал, что в Церкви Девы Марии в Ашмунайн было несколько алтарей, мраморные колонны, но только один алтарь, постоянно используемый для Божественной Литургии, потому что над ним располагается отпечаток руки Христа.
Археологические раскопки проводились в городе Ашмунайн дважды: первый раз экспедицией из Оксфордского университета, а второй раз – немецким археологом Петером Гроссманном в 1989г. Было установлено, что в городе находятся несколько зданий и там есть развалины всех периодов. На самом деле область Ашмунайн отличается священную историю, так как её земля была полита кровью мучеников в эру мученичества.
