Эта церковь является старейшей в монастыре и уникальна своей простой структурой, принимая во внимание её обслуживание, ремонты и модификации, которые были проведены за всю историю церкви. Церковь нельзя классифицировать по геометрическому стилю архитектурного искусства каких-либо коптских церквей. Иными словами, эту церковь отличает простая и несложная – не фактурная – архитектурная структура. Она построен из высушенного на солнце кирпича. Стены церкви несимметричны и не-систематичны. На стенах церкви нет декоративных древних коптских изображений, гравюр, мозаик или рисунков… и т. д.
Святилище:
Лоно Авраамово – изогнутая полукруглая область в восточной стене «святилища»: символ тоски Бога по Его Церкви, которая ожидает Его пришествия.
По обе стороны святилища также были построены два других помещения. Они явно намного проще любого архитектурного искусства. Тем не менее, они построены в соответствии с древним традиционным ритуалом церкви. Левая (Северная) комната используется в качестве ризницы; комнату для переодевания священнослужителей, и там не было двери в неф церкви. Правая (Южная) комната предназначалась для службы диаконов, где хранился «Набор для Святого Причастия». Там также было отверстие в полу, в нижней части его восточной стены, для опорожнения кадила (кадильницы) после окончания божественной службы.
Стоит упомянуть, что во время реставрации и восстановления церкви в 2000 году н.э. было обнаружено, что восточная стена – это не одна, а скорее две стены с промежутком, достаточным для того, чтобы там мог стоять человек. Из этого пространства был проход в южную комнату святилища. Согласно церковному ритуалу вокруг алтаря должны быть воздвигнуты четыре столба, так как они символизируют четырёх Евангелистов. Однако из-за узкости этого святилища были поставлены и закреплены к правой и левой стенам только три столба. Четвертый столб был добавлен позже во время той же реставрации, о которой говорилось выше.
Позднее, в XVI веке, были достроены три купола над святилищем и двумя комнатами с каждой стороны.
Алтарь:
Алтарь является самым важным местом в святилище. Алтарь имеет кубическую форму, а не равностороннюю. На поверхности алтаря мрамор полукруглой формы, где выгравирована греческая надпись: «О, Господи, упокой блаженного Кульфоса» датируемая Кяхком 15-м, в 463 году от Сотворения мира (11 декабря 746 г.н.э. по современному календарю того периода).
Этот полукруглый мрамор считается своеобразной формой, которая отличает древние коптские алтари в Египте. Идея полукруглой формы является древней коптской традицией, впервые появившейся в иконах Тайной вечери, где стол полукруглый.
Согласно коптской церковной традиции, «алтарь» церкви Святой Девы Марии находится «посреди земли Египетской». Это выполнение слов Господа, переданных через Пророка: «В тот день посреди Египта будет стоять жертвенник Господа, а у границы — священный камень Господа» (Исаия 19:19). Входы в святилище все низкие: когда верующий проходит через него, то его голова склоняется в смирении и уважении к дому Господнему.
Масляные Лампы и Страусиные Яйца:
В то время как церковь считается символом Неба, масляные лампы и свечи стоят как символ для звёзд. Ибо если реальное небо украшено светящимися звездами, то должны быть украшены и духовные Небеса.
Масляные лампы ставятся перед иконами во время божественной литургии. Они заполняются чистым оливковым маслом, и ставятся за Иисуса Христа, который светится через Своих святых. В настоящее время единственная оставшаяся в церкви масляная лампа находится в стене восточной части святилища. Эта лампа постоянно горит, чтобы в церкви не использовался никакой посторонний огонь, как символ того, что сказал Господь Моисею: «… чтобы в светильнике постоянно поддерживался огонь…» (Исход 27:20–21). Восточный светильник также символизирует звезду, которая явилась мудрецам с Востока в Леванте.
Страусиные яйца в церкви символизируют Божественное Провидение и Воскресение Христа.