Египетская церковь Святого Семейства находится у восточной заставы Египта в египетском городе Рафах. Церковь является важным религиозным и туристическим местом, в которое стекаются туристические группы из Египта и из-за границы. Церковь была построена в форме Ноева Ковчега.
Также как праведный Ной и его сыновья отправились к ковчегу, чтобы спастись от потопа, так и Господь Христос, Божия Матерь, Святой Иосиф Плотник и Саломея отправились в Египет, чтобы спастись от дьявольского лика, поскольку Ангел Господень сказал Иосифу во сне: «Встань, возьми Младенца и Матерь Его и беги в Египет, и будь там, доколе не скажу тебе, ибо Ирод хочет искать Младенца, чтобы погубить Его. Ночью Иосиф встал, взял Младенца с матерью Его и бежал в Египет. И исполнилось Священное Писание: из Египта я позвал сына своего» (Евангелие от Матфея 2:13 – 2:14).
Известно, что Святое Семейство прошло почти 100 км с момента своего отбытия из Вифлеема в Палестину до прибытия в Синайскую пустыню. Вполне естественно, что Святое Семейство не пользовалось общей дорогой во время своего тернистого путешествия, а должно было продвигаться далеко и скрытно, чтобы избежать последователей и преследователей.
Среди унаследованных преданий о путешествии Святого Семейства на землю Египта есть такое: они прошли расстояние в 18 километров, пока не достигли города Фарес, и там услышали известие о расправе над детьми Вифлеема. После этого Святое Семейство стало настойчиво пытаться выйти, но городские ворота оставались закрытыми, и там была выставлена охрана. Когда Святой Иосиф попытался добиться разрешения покинуть город, охранники отказали ему в этой просьбе, поскольку у них не было ключей, и они попросили его подождать до утра, пока не придет их начальник. Ночью стало очень холодно, поэтому охранники прошли в свои комнаты, чтобы согреться, а Святое Семейство осталось у дверей. Богородица, Дева Мария, положила руки ребёнка на замки, двери сразу открылись, и они покинули город. После этого двери вернулись в прежнее положение, а когда охранники узнали о случившемся и попытались открыть замки, то у них ничего не получилось. Тогда они убедились, что Иисус не обычный младенец.
Святое Семейство поспешило к городку Беершеба, после чего Святое Семейство захотело немного отдохнуть, и они направились к пещере. Когда они уже собрались войти в неё, то оттуда выскочили лев и львица, желая их убить. Вдруг Младенец Иисус посмотрел на этих двух зверей, и звери отошли немного от входа, показав признаки своего подчинения, а потом они стали охранять вход в пещеру.
Господь обнаружил источник воды для Святого Семейства, они напились воды из него и наполнили свои бутылки водой для дальней дороги. Ближе к вечеру они покинули это место, а звери попрощались с ними и склонили свои головы. Затем Святое семейство прошло ещё 83 км, пока не добралось до города Авга-эль-Хафир, а покинув его, направилось в район Рафаха.
Существует также народное предание, согласно которому Святое Семейство подверглось нападению двух бандитов, которые отобрали у них их простые пожитки, но их остановило светящееся, как солнце, лицо младенца, чудесное явление красоты и достоинства Благословенной Богородицы, а также кротость Иосифа, плотника, и полное отсутствие у него сопротивления им. Бандитам стало стыдно, и они смилостивились над Святым Семейством. Они вернули то, что отняли у них, и извинились за содеянное. Затем один из них предложил свою помощь и взял платок, чтобы вытереть пот младенца Иисуса. Он обнаружил, что запах от платка непорочный, очень удивился и выжал влагу из ткани во флакон. Рассказывали, что встреча со Святым Семейством очень сильно повлияла на этого вора, и он попросился сопровождать их, чтобы защищать их на всём пути. Наконец, на египетской границе недалеко Эль-Фармы, вор попросил разрешения покинуть Святое Семейство, чтобы вернуться туда, где он должен был находиться.
Народ Рафаха хорошо относился к этой благословенной семье. Его народ принимал Иисуса и его Мать, Деву Марию. Пока семья находилась там у дерева, там внезапно возник пресноводный источник, питьевая вода из которого до сих пор доступна посетителям. Однако сейчас трудно добраться до этого источника из-за большого количества антитеррористических операций на Синае, проводимых армией.