Von den vielen Wundern und Ereignissen in Verbindung mit diesem Heiligen Ort sind hier zwei kurz erwähnt:
Als die Betenden nach dem Gottesdienst am Freitag, den 3. Baramhat, 12. März 1976, in den Hof mit Blick auf den Nil gingen, sahen sie, wie ein geöffnetes großes Buch an der Wasseroberfläche des Nils an das Ufer geschwemmt wird. Als man das Buch aus dem Wasser zog, erkannte man, dass es die Bibel ist. Sie war auf eine Seite geöffnet, in der das Kapitel 19 des Buches Jesaja steht, das den Vers enthält: „Gesegnet bist du, Ägypten, mein Volk“ (Jesaja 19:25). Das Buch ist auf diese Seite geöffnet in einem Glasschrank zu besichtigen, um den Segen daraus zu erhalten.
Und im Jahr 1986 besuchte die Kirche eine Gruppe von Gläubigen aus Alexandria. Einer der Besucher machte ein Foto von der Bibel hinter dem Schaukasten. Als er das Foto entwickelte, hatte das Foto einen eingeprägten Schimmer auf der Bibel in einem Umriss, der die Heiligen Familie darstellt. Er schickte das Foto an die Kirche und es kann heute im Schaukasten neben der Bibel besichtigt werden.
Unter den Ereignissen, die in der Kirche stattfanden, berichtet uns der koptische Heiligenkalender (Synaxar) vom Entschlafen des 106. Patriarchen, Papst Markus VII. während seines Besuchs in der Kirche am 12. Baschans des Jahres 1485 nach dem koptischen Kalender, entsprechend dem 18. Mai 1769 n. Chr. Die Gläubigen trugen ihn von der Kirche zum Hl. Georg Nonnenkloster in Alt-Kairo, wo er im Schrein des Heiligen Georg blieb, bis sie seinen Leichnam am Morgen zur Kirche des Märtyrers Mercurius in Alt-Kairo trugen, wo das Requiem abgehalten und er bestattet wurde.