1- Batistério Antigo:
Existiu no lado norte da igreja de São Iskhyrun datada do século IV. Onde se supunha que São Moisés, o negro, tinha sido batizado. Já não está a ser utilizado e foi substituído por um novo.
2- Refeitório Antigo:
Está localizado no lado ocidental da igreja de São Bishoy, sendo datado do século IV. Está separado da igreja por uma antiga ruela de dois metros de largura.
Inclui muitos artigos arqueológicos, para além de várias imagens antigas.
A tradição dos monges era de se reunirem no antigo refeitório após a missa dominical para partilhar a comida, costumavam sentar-se no chão de acordo com a sua ordenação monástica, enquanto o abade se sentava na ponta da mesa e lia algumas escrituras da Bíblia Sagrada.
O antigo refeitório já não é utilizado e foi substituído por outro novo.
3- Moinho Antigo:
Datado do século IV, é constituído por uma enorme pedra com uma grande peça de madeira que era rodada pela força dos animais. Possui duas salas no lado norte, uma para armazenar trigo e a outra para armazenar farinha. Este moinho já não é utilizado.
4- Poço dos Mártires
Trata-se do verdadeiro poço da era de São Bishoy, onde os berberes lavaram as suas espadas com o sangue dos mártires depois de os terem matado no mosteiro de São Macário, no terceiro ataque em 444 d.C., foram martirizados quarenta e nove anciãos de Scetis.
A profundidade do poço é de 12 metros, sendo que o poço não está a ser utilizado, não obstante os monges terem cavado outros poços.
5- Cemitério dos Monges
Local onde todos os monges são enterrados após a sua morte, está localizado no lado ocidental da igreja de São Jorge e é datado do século IX.
S.S. o Papa Shenouda III construiu um novo em 1986 d.C. perto do antigo cemitério.
6- Fortaleza Antiga
Datada do século V, 474 d.C., estando localizada no lado direito da entrada principal, a sua área é de 20x20m2 e a sua altura é de 25m. Foi construída pelo Imperador Zeno.
A fortaleza é quadrada, a espessura da sua parede é de 2m de largura e é constituída por três andares:
Primeiro andar: inclui um poço com 18m de profundidade, salas para monges e um espaço para armazenamento de sementes.
Segundo andar: onde se encontra a Igreja da Virgem Maria, um fogão e uma biblioteca.
Terceiro andar: onde se encontra a igreja do Arcanjo Miguel. Ibrahim el-gohary tinha restaurado esta igreja, na qual o véu do santuário é datado de 1783 d.C.
A ideia de fortaleza
Um monge costumava estar na parte superior da fortaleza para vigiar ao longe a aproximação dos berberes, assim que os via, começava a tocar o sino e os monges reuniam-se entrando na fortaleza através de uma ponte que terminava com um mosquetão.
Depois o monge puxava a ponte com uma corda enrolada numa roldana e fechava assim a fortaleza. Os monges permaneciam lá dentro até que os berberes partissem.
7- As Celas Antigas:
São datadas do século IX, estando localizadas na antiga muralha. Já não são utilizadas e foram substituídas por outras novas.
8- Antiga Muralha do Mosteiro
Datada do século IX, foi construída pelos monges. A sua largura é de 2m de largura, o seu comprimento de 15m de comprimento e foi construída com pedra de sílex.
